說起北管，一般人對它的印象要不是很模糊，就是認為它是過氣的流行音樂。但為何一個芳齡還不滿18歲的小女生，卻選擇它作為終身投入的工作，還成為教育部薪傳獎得主北管大師邱火榮門下得意的女弟子？20多年後，回想起當年入行過程，謝琼崎說：「這一切都是緣分」。
陪考變上榜 誤入傳統音樂學系
謝琼崎高中時念的是國樂科，主修揚琴，並以大學繼續唸國樂系作為她的升學目標。高三時，班上有位同學想要報考國立臺北藝術大學的傳統音樂學系，聽說邱火榮老師的北管專業演出極富盛名，於是找了謝琼崎壯膽一起去上課，這是她接觸北管的開始。後來謝琼崎抱著陪考的心情也一同報考，結果放榜後她錄取了，同學卻落選。顯然計畫趕不上變化，這件事攪亂了原本謝琼崎想念國樂系的想法，但因為已經先考上大學了，她也無心再準備其他考試，於是就這麼誤打誤撞的進了傳統音樂學系。
原本她與邱火榮老師學的是以文場拉弦和演唱為主，目的只是應付考試而已，對北管還不是很了解，進了學校後，才知道學習北管可不是這麼容易，必須「吹、拉、彈、打、唱」樣樣具備，各種樂器都要會，否則在這行是無法生存的。掙扎了一陣子，她本想打退堂鼓，尤其是學校的老師大都年長居多，這些年齡加起來超過1000歲的師資陣容，真讓還是小女生的她有些畏怯。
幸而當時邱火榮老師很鼓勵她，也常帶領同學去觀摩一些演出，逐漸培養出她對北管的興趣。1997年升大三時，在邱老師的推薦下，她參加當時文建會「小西園掌中劇團後場藝生培訓計劃」徵選並順利錄取，展開了為期3年的課程訓練，每星期都要去「小西園」上課，學習與北管有關的各種傳統樂器與戲曲。畢業後在師兄林永志（臺北木偶劇團團長）的牽引下，進入專業劇團擔任行政與後場樂師的領域，在邱老師的帶領下更是參加各色大大小小的演出，收獲相當豐富。
發揮拼命三娘精神 努力闖出一番成績
可是當一個後場樂師絕不是一件簡單的事，各項文武場樂器及唱腔都要能掌握。以布袋戲為例，通常有所謂「三分前場，七分後場」的說法，前場的表現固然重要，後場的配合更有舉足輕重的影響力，若沒有優秀的後場，整場演出必然大打折扣。後場樂師的基本編制包含鼓佬、頭手絃吹、二手絃吹、鑼抄手，每個人都要負責多項樂器如板鼓、通鼓、鑼鈔、殼仔弦、三弦、笛子、嗩吶等等，「如果樂師熟悉的樂器越多，代表技藝備受尊崇，也越能突顯個人價值。」
剛開始在客串演出中，儘管老藝師們對於經驗有限的她很是包容，但她也更加意識到自身技藝的不足，因為旁人期許激起了自己的上進心，開始投入成倍的時間瘋狂練習。「哈哈哈，當初我在學校很混，出了校外參加演出就很拚」，想起這段往事，謝琼崎不禁笑了出來。就這樣，她火力全開，以一副拚命三娘的姿態勇闖北管藝界。
「做北管這一行，要學的實在太多了！」以當年90歲高齡指導她的葉美景老師為例，雖年事已高，但仍不停的在學習，恩師邱火榮老師亦是如此，不論是北管戲、歌仔戲、布袋戲後場音樂都精通，擅長至少十餘種傳統樂器，還學習京劇音樂和西樂，薩克斯風也難不倒他。老師們就是她最好的模範，走在北管這條路上，永不停止的學習就是她努力的方向。
成立「臺北木偶劇團」為布袋戲盡一份心力
為了對北管這項傳統藝術有更多的了解，謝琼崎大學畢業後，決定繼續攻讀碩士班，在國立臺北藝術大學傳統藝術研究所兩年課程中，深入探索傳統音樂、戲劇的歷史和文化，對北管這項傳統更增添了一份尊重與愛護之心。研究所老師帶領他們去做田野調查，把一些珍貴的照片和史料保留下來，讓她深深明白文化遺產與承傳的重要性。謝琼崎很慶幸自己有去研究所進修，這與她只是作為一個大學生，或者當一個後場樂師純粹是演奏者的角度完全不同，研究所的訓練對她後來在劇團做行政和企劃也非常有幫助，在撰寫案子的時候不會只用表演者視角來書寫，而是會用更寬闊的角度來看待事情，希望每個演出都能賦予它更豐富的文化意涵。
2010年，謝琼崎和林永志及幾個志同道合的朋友，一起組成了臺北木偶劇團。「當時我們都是2、30歲的年輕人，也非家班出身，只是單純對這個行業有興趣，因為我們不僅想持續傳承傳統，更想要在面對新的世代時，為傳統藝術打造出新面貌，所以就決定一起組個新劇團，為布袋戲的薪傳盡一份心力。」
成立10年以來，臺北木偶劇團表現很亮眼，他們發揮過去在各劇團習藝時所累積的豐富經驗，在不拘泥於傳統木偶劇的創作形式下，以多元及多變的木偶劇場藝術特色，創作出更細膩、精緻的表演方式，讓更多年輕觀眾對布袋戲產生興趣，成立至今演出不下上千場，已成為臺灣具活力的新生代木偶劇團之一。
邱火榮老師至今桃李滿天下，作為老師門下得意女弟子，謝琼崎一身技藝雖然已得到老師肯定，但依然不敢鬆懈，要求自己更加努力，要讓曾經是民間最火紅的北管音樂繼續發光發熱，不負恩師的苦心栽培。